HOWTO 文書

いろいろなHOWTOを掲載します

目標としては、普通の生物学の大学院生にわかるレベルの詳しさ

• JBrowseのインストールと設定
• pbalignのインストール~quiver
• SGE Array Jobの例
• wgetが証明書の検証に失敗する件について
• イルミナPEシーケンスを参照配列にマッピングする
• インサート長の分布を調べる
• イルミナMPシーケンスを参照配列にマッピングしてインサート長の分布を調べる
• k-mer analysis and genome size estimate
• bwaをOS Xにインストールする例
• 多数の配列についてBLAST検索
• sh scriptにおける引用符
• 双方向BLASTベストヒット
• UTGBでカスタムトラックを作る
• ヒメツリガネゴケゲノムの制限酵素サイトを数える
• ABySS
• trinity
• molphy on 64 bit system
• primer検索用データベース設定
• 日本におけるdUTP取り扱い試薬会社リスト